Organi udruženja „Centar za devojke“ su Skupština, Savet, Programsko – koordinaciono telo i koordinatorke projekata.
Skupštinu Udruženja čine svi/e njegove članovi/ice.
Savetse sastoji od pet članica. Savet je nezavisan u svom radu u odnosu na ostale organe Udruženja i kontroliše finansijsko poslovanje udruženja i o uočenim nepravilnostima bez odlaganja obaveštava Programsko-koordinaciono telo. Rad Saveta se ne plaća.
Savet Centra za devojke čine:
Maja Kamenov,
Sanja Krstić,
Nevena Milinčić,
Nadica Kuculović Josifovski i
Milena Krstić Obradović.
Programsko – koordinaciono telo je izvršni organ udruženja, koji se stara o sprovođenju ciljeva Udruženja. Programsko – koordinaciono telo čine četiri koordinatorke:
Tatjana Nikolić – izvršna koordinatorka
Marija Virijević – koordinatorka programa
Marta Stanojević – koordinatorka finansija
Sara Plazinić Nikolić – koordinatorka za rad sa korisnicama